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正确传播菌群研究成果,势在必行!

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发表于 2019-6-6 10:32:06 | 显示全部楼层 |阅读模式


Science:肠道菌群对药物代谢的贡献有多大?
Science[IF:41.058]
① 宿主和肠道细菌共同参与药物代谢,药物反应的个体差异性与肠道菌群的基因差异有关;② 利用无菌小鼠、药物代谢酶缺失细菌构建限菌小鼠模型,发现核苷类抗病毒药物溴夫定转化为肝毒性代谢物的过程,71%由肠道菌群完成;③ 该模型可用于定量测定宿主和肠道菌群对药物代谢的贡献,并成功检测了抗病毒药索利夫定的代谢情况;④ 利用无菌小鼠构建类似模型,证明肠道细菌参与了氯硝安定及相关药物的还原过程,该代谢过程也与药物毒性相关。
Separating host and microbiome contributions to drug pharmacokinetics and toxicity
02-08, doi: 10.1126/science.aat9931
【主编评语】肠道菌群参与药物代谢过程。Science近期发表了一篇方法学研究,阐述了一种可定量测定肠道菌群对药物代谢贡献的方法,测定了肠道细菌对若干核苷类抗病毒药物、抗焦虑药物的代谢影响。该模型对评估肠道菌群在药物、营养成分等物质代谢过程中的作用具有重要参考价值。
Nature:发掘未知的肠道细菌
Nature[IF:41.577]
① 从11850个人类肠道菌群基因组中,鉴别出1952种潜在的、未被培养的肠道细菌;② 这些潜在细菌,将已知肠道细菌的总种类数量增加了281% ;③ 新发现的细菌在欧美人群中并不普遍,但却极大地丰富了对非洲、南美人群肠道细菌种类的了解,对已知细菌种类的增幅超过200%;④ 潜在细菌的基因组上存在上百种新的生物合成基因簇,可能在宿主中发挥特殊作用;⑤ 潜在细菌的基因组的发现,显著增加了对肠道菌群种类和功能的了解。
A new genomic blueprint of the human gut microbiota
02-11, doi: 10.1038/s41586-019-0965-1
【主编评语】解读肠道菌群结构存在的宿主差异有助于阐释菌群对宿主健康的具体影响。Nature近期发表研究,鉴别出了1925种潜在肠道细菌,极大地丰富了已知肠道菌群种类和功能,尤其丰富了非洲和拉美地区人群的肠道菌群信息。该研究对详细阐释肠道菌群种类和功能具有参考价值。
华大基因团队:1520个人肠道单细菌参考基因组,助力菌群研究
Nature Biotechnology[IF:35.724]
① 用培养组学分离>6000个人粪便菌株,得到1520个高质量单菌基因组草图(338个种),构成可培养基因组参考(CGR)数据集;② 包括人肠道的主要细菌门和属,含至少264个新参考基因组,有不少低丰度菌,丰富了现有参考基因组,提高了宏基因组学分析的分辨率(读段比对率和SNP分析等);③ 对CGR的功能注释加深了对肠道菌功能的认知;④ 对38种重要菌的泛基因组分析,揭示不同菌门的泛基因组开合趋势和在各自核心和非核心基因组上功能富集的差异。
1,520 reference genomes from cultivated human gut bacteria enable functional microbiome analyses
02-04, doi: 10.1038/s41587-018-0008-8
【主编评语】华大基因的肖亮、贾慧珏和李俊桦与团队的重要研究,近期在Nature Biotechnology发表。该研究通过培养组学方法,从健康人粪便样本中获得1520个单菌基因组草图,对现有的人肠道细菌参考基因组有很大补充;并通过功能注释和泛基因组分析,加深了对肠道细菌功能和特点的了解。这些成果将助力人肠道宏基因组学分析和相关应用转化研究,值得专业人士仔细阅读。
Nature子刊:包含近800个肠道菌株全基因组数据的新数据集
Nature Biotechnology[IF:35.724]
① 发布人体胃肠道细菌培养集(HBC)数据,HBC包含了来自4个门、31个科、273个种的737个菌株的全基因组数据;② HBC使已有的人体胃肠道细菌基因组数量增加了37%;③ 相比于人类微生物组(HMP)计划,包含HBC在内共计1354个基因组的人体胃肠道细菌基因集(HGG)将系统分类效率提高了61%,近50%的序列可被分类到亚种级;④ 新的HGG提高了对宏基因组样本分类的分辨率,并能鉴定出人肠道菌群中的新菌种,同时增加了41个新描述的功能。
A human gut bacterial genome and culture collection for improved metagenomic analyses
02-04, doi: 10.1038/s41587-018-0009-7
【主编评语】Nature Biotechnology上发表的一项最新研究,发布了一个新的人体肠道细菌基因组数据集,包含了来自4个门、31个科、273个种的737个菌株的全基因组数据,这些菌株是从20个成年人的粪便样本中培养并分离的。该数据集使人体胃肠道细菌基因组的数量增加了37%。
Lancet:从更高层面认识和解决全球肥胖问题
Lancet[IF:53.254]
① 肥胖、营养不良和气候变化在全球范围内相互作用,形成“全球共疫”,威胁人类健康和环境发展;② 食品与农业、运输、城市设计和土地使用是驱动全球共疫的主要系统因素,应针对性地制定一石二鸟/三鸟的干预策略;③ 通过国际和国家治理、民间参与等多层面的措施,如将健康权纳入人权法、签署食品系统公约等,促进政策转变,并加强问责;④ 必须减少商业利益对政策制定的影响,并改变商业模式,从只注重短期利润向可持续发展和促进健康转化。
The Global Syndemic of Obesity, Undernutrition, and Climate Change: The Lancet Commission report
01-27, doi: 10.1016/S0140-6736(18)32822-8
【主编评语】全球肥胖问题日益严重,尽管已有一些措施出台,但整体收效甚微。《柳叶刀》全球共疫委员会(Lancet Global Syndemic Commission)近期发表长篇报告,将肥胖、营养不良和气候变化视为“全球共疫”(具有内在关联的协同流行性疾病),分析了三者背后的共通驱动因素,从商业模式、食物系统、民间参与、国际和国家治理等角度提出了不少措施方法,以期从“全球共疫”的层面解决肥胖问题。

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